云龙如惊弓之鸟,心里越来越慌,假意告诉秋红只要和他再做一天夫妻,他便会去自首,秋红满心欢喜地答应了,谁想第二天,做过夫妻,抽过大烟的云龙又再次反水,不愿去自首。秋红没有办法,决定杀了云龙后再自杀。秋红举起剪刀正要动手,却被云龙发现,云龙挥掌将秋红打死。
得到刘妈报信的云飞赶来,却发现房间里只剩下秋红的尸体,云龙早已逃之夭夭。李云龙化妆成了老人,躲在客来回客栈,躲避公安的抓捕。不料他的踪迹被李云馨发现,二人一场激战,李云馨渐占上风,云龙被打得奄奄一息。眼见云龙就要被云馨勒死,李云龙却再此使诈,趁云馨不备一脚将她踢晕在地。就在云龙要置云馨于死地的危难关头,白凝赶来救下云馨,并在云龙扔下手雷后紧紧抱住了云馨,替云馨挡住了手雷的弹片。
白凝被送往医院,伤势十分严重,医生尽了很大的努力仍也没能将白凝救活。此时,云馨跑来用惊人掌力将白凝救活。
云龙偷盗尚市长的住宅,却发现尚市长家竟是一贫如洗。云龙毒瘾发作,实在搞不到毒品,便来到了刚刚改作药铺的烟馆。在吸食大烟后,他将想要抓捕他的伙计二噶打死。
公安局布防的包围圈越来越小,铁嘴霸王也参与到治安联防的队伍中,发动群众四处搜捕,飞贼李云龙无处遁形。无奈之下,云龙只得留信给云飞,要与他做生死了断,云飞在普照寺找到了云龙,二人以门里的规矩做生死了断。二人一路追逐打到了重型机械厂,几番恶战之下,云龙渐渐落了下风。
从航车到冷却池,重型机械厂内云飞和云龙几番番缠斗,最终云飞使出堂畿大师传授的推碑手,将云龙制服。匆匆赶来的云馨要手刃云龙,却被云飞制止,说云龙应该得到百姓的审判。
云飞跑到医院看望白凝,告诉了白凝已将云龙擒获的好消息,并告诉白凝云馨已经还俗,等白凝出院二人便可以成亲了。
云龙被带回了公安局监狱,云飞不但给云龙大烟抽,还和云龙铐在一起,为他疗伤,云龙向云飞认罪,得知云飞一直念着同门之情并不怪罪于他。云龙伤愈,云飞要对云龙进行最后的审讯,在审讯过程中,云龙得知共产党已经查清师傅并非自己所杀,还了自己的清白,云龙决定认罪画押。得知在公审大会后将被枪决时云龙后悔莫及。
出于同门之谊,李云馨来到监狱看望云龙,云龙向云馨吐露真情,说这辈子爱过的女人只有师姐云馨一个。云馨见云龙对自己犯下的罪行真心忏悔,便去求云飞宽恕云龙,但云飞说,现在云龙已经罪大恶极,没有人能救得了他了。
云龙被人民政府处决,结束了其亦正亦邪的一生。他的坟前,云飞与云馨相对无言。重新回到书场的铁嘴霸王说起了新燕子李三的故事,由衷地感慨道:人民政府威力大,得民心者得天下。